Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.89□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Pcdhb18-201ENSMUST00000055949 5041 ntAPPRIS P1 BASIC9.88□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC9.87□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Zbtb40-201ENSMUST00000049583 7192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.86□□□□□ -0.83
SptssbQ925E8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms