Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDP2

UPF0428 protein CXorf56 homolog, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8VDP2 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q8VDP2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Q8VDP2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Q8VDP2 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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