Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW5

Sh2d5, SH2 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d5Q8JZW5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Sh2d5Q8JZW5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Sh2d5Q8JZW5 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms