Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW3

Bhlhe23, Class E basic helix-loop-helix protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe23Q8BGW3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Bhlhe23Q8BGW3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Bhlhe23Q8BGW3 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms