Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Vipas39Q8BGQ1 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Vipas39Q8BGQ1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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