Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Efr3bQ6ZQ18 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Efr3bQ6ZQ18 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms