Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
BC061212Q6P8K3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
BC061212Q6P8K3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms