Protein–RNA interactions for Protein: Q6P6J4

Alkbh2, DNA oxidative demethylase ALKBH2, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh2Q6P6J4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Alkbh2Q6P6J4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Alkbh2Q6P6J4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 696.6 ms