Protein–RNA interactions for Protein: Q60737

Csnk2a1, Casein kinase II subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a1Q60737 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Csnk2a1Q60737 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Csnk2a1Q60737 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms