Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Prdm1Q60636 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Prdm1Q60636 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms