Protein–RNA interactions for Protein: Q60632

Nr2f1, COUP transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr2f1Q60632 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nr2f1Q60632 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nr2f1Q60632 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms