Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LRCH2Q5VUJ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
LRCH2Q5VUJ6 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms