Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Utp18Q5SSI6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Utp18Q5SSI6 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms