Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTK1

Chsy3, Chondroitin sulfate synthase 3, mousemouse

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Length 884 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chsy3Q5DTK1 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Chsy3Q5DTK1 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Chsy3Q5DTK1 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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