Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc27Q3V036 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc27Q3V036 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms