Protein–RNA interactions for Protein: Q3UNB8

Tmem253, Transmembrane protein 253, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem253Q3UNB8 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tmem253Q3UNB8 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
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