Protein–RNA interactions for Protein: Q1HDU4

Arhgap9, ArhGAP9, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap9Q1HDU4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Arhgap9Q1HDU4 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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Arhgap9Q1HDU4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Arhgap9Q1HDU4 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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Arhgap9Q1HDU4 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Arhgap9Q1HDU4 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms