Protein–RNA interactions for Protein: Q12675

DNF2, Phospholipid-transporting ATPase DNF2, yeastyeast

Predictions only

Length 1,612 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DNF2Q12675 YER053C-AYER053C-A 114 nt-2.41□□□□□ -2.8
DNF2Q12675 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt-2.43□□□□□ -2.8
DNF2Q12675 YJR087WYJR087W 351 nt-2.46□□□□□ -2.8
DNF2Q12675 YKL083WYKL083W 615 nt-2.47□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt-2.47□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 YHR125WYHR125W 306 nt-2.48□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 YGR025WYGR025W 303 nt-2.49□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 JLP2YMR132C 627 nt-2.49□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 snR77snR77 88 nt-2.5□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 YDL011CYDL011C 324 nt-2.51□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 YPL229WYPL229W 621 nt-2.51□□□□□ -2.81
DNF2Q12675 EAF6YJR082C 342 nt-2.53□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YKL044WYKL044W 321 nt-2.53□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YEL020C-BYEL020C-B 198 nt-2.54□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YLR456WYLR456W 615 nt-2.54□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YBR285WYBR285W 435 nt-2.54□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 snR39BsnR39B 96 nt-2.57□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YDR426CYDR426C 378 nt-2.57□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 ATG16YMR159C 453 nt-2.58□□□□□ -2.82
DNF2Q12675 YGR240C-AYGR240C-A 201 nt-2.6□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 YNL205CYNL205C 423 nt-2.6□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 YOR121CYOR121C 306 nt-2.6□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 TSC3YBR058C-A 243 nt-2.63□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 YFL012WYFL012W 447 nt-2.64□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 tQ(UUG)QtQ(UUG)Q 76 nt-2.65□□□□□ -2.83
DNF2Q12675 CSE2YNR010W 450 nt-2.67□□□□□ -2.84
DNF2Q12675 YMR315W-AYMR315W-A 108 nt-2.69□□□□□ -2.84
DNF2Q12675 YAF9YNL107W 681 nt-2.69□□□□□ -2.84
DNF2Q12675 YGR270C-AYGR270C-A 219 nt-2.71□□□□□ -2.84
DNF2Q12675 YER090C-AYER090C-A 90 nt-2.72□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 BI2Q0110 1272 nt-2.74□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt-2.74□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 RPS27BYHR021C 249 nt-2.75□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 YLR217WYLR217W 324 nt-2.75□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 YBL071CYBL071C 309 nt-2.75□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 YER175W-AYER175W-A 165 nt-2.76□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 YLR202CYLR202C 327 nt-2.77□□□□□ -2.85
DNF2Q12675 snR9snR9 187 nt-2.81□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt-2.81□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 PCC1YKR095W-A 267 nt-2.81□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 TOM22YNL131W 459 nt-2.82□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 PRM3YPL192C 402 nt-2.82□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 GPI15YNL038W 690 nt-2.84□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 YNL266WYNL266W 420 nt-2.84□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 YOR309CYOR309C 381 nt-2.84□□□□□ -2.86
DNF2Q12675 YML054C-AYML054C-A 159 nt-2.85□□□□□ -2.87
DNF2Q12675 YDR544CYDR544C 429 nt-2.86□□□□□ -2.87
DNF2Q12675 YDR048CYDR048C 315 nt-2.9□□□□□ -2.87
DNF2Q12675 YGR174W-AYGR174W-A 87 nt-2.9□□□□□ -2.87
DNF2Q12675 YDL016CYDL016C 303 nt-2.92□□□□□ -2.88
DNF2Q12675 YMR172C-AYMR172C-A 384 nt-2.92□□□□□ -2.88
DNF2Q12675 YGR069WYGR069W 336 nt-2.93□□□□□ -2.88
DNF2Q12675 snR50snR50 90 nt-2.94□□□□□ -2.88
DNF2Q12675 snR34snR34 203 nt-2.97□□□□□ -2.89
DNF2Q12675 YJR162CYJR162C 351 nt-2.98□□□□□ -2.89
DNF2Q12675 YNL337WYNL337W 255 nt-2.98□□□□□ -2.89
DNF2Q12675 YOR314W-AYOR314W-A 111 nt-2.98□□□□□ -2.89
DNF2Q12675 YIL029CYIL029C 429 nt-3.04□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 YLL019W-AYLL019W-A 93 nt-3.04□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 ATP19YOL077W-A 207 nt-3.04□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 YOL083C-AYOL083C-A 141 nt-3.04□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 YLR269CYLR269C 351 nt-3.06□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 snR69snR69 101 nt-3.08□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 snR67snR67 82 nt-3.09□□□□□ -2.9
DNF2Q12675 YJL197C-AYJL197C-A 282 nt-3.11□□□□□ -2.91
DNF2Q12675 YML099W-AYML099W-A 330 nt-3.11□□□□□ -2.91
DNF2Q12675 YGL149WYGL149W 306 nt-3.12□□□□□ -2.91
DNF2Q12675 YAR047CYAR047C 321 nt-3.12□□□□□ -2.91
DNF2Q12675 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt-3.17□□□□□ -2.92
DNF2Q12675 YDR102CYDR102C 333 nt-3.18□□□□□ -2.92
DNF2Q12675 HMRA1YCR097W 381 nt-3.19□□□□□ -2.92
DNF2Q12675 YOR008C-AYOR008C-A 225 nt-3.21□□□□□ -2.92
DNF2Q12675 YER137W-AYER137W-A 306 nt-3.28□□□□□ -2.93
DNF2Q12675 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt-3.31□□□□□ -2.94
DNF2Q12675 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt-3.32□□□□□ -2.94
DNF2Q12675 YOR072W-BYOR072W-B 162 nt-3.33□□□□□ -2.94
DNF2Q12675 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt-3.38□□□□□ -2.95
DNF2Q12675 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt-3.45□□□□□ -2.96
DNF2Q12675 YER097WYER097W 330 nt-3.46□□□□□ -2.96
DNF2Q12675 YDL158CYDL158C 309 nt-3.48□□□□□ -2.97
DNF2Q12675 MPC1YGL080W 393 nt-3.49□□□□□ -2.97
DNF2Q12675 CSN9YDR179C 489 nt-3.5□□□□□ -2.97
DNF2Q12675 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt-3.5□□□□□ -2.97
DNF2Q12675 YLR286W-AYLR286W-A 135 nt-3.54□□□□□ -2.98
DNF2Q12675 YGR146C-AYGR146C-A 162 nt-3.56□□□□□ -2.98
DNF2Q12675 YFL032WYFL032W 321 nt-3.62□□□□□ -2.99
DNF2Q12675 YPR197CYPR197C 564 nt-3.63□□□□□ -2.99
DNF2Q12675 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt-3.66□□□□□ -2.99
DNF2Q12675 tM(CAU)Q2tM(CAU)Q2 78 nt-3.66□□□□□ -2.99
DNF2Q12675 YDR524C-AYDR524C-A 120 nt-3.68□□□□□ -3
DNF2Q12675 YER181CYER181C 324 nt-3.69□□□□□ -3
DNF2Q12675 snR54snR54 86 nt-3.69□□□□□ -3
DNF2Q12675 YOR316C-AYOR316C-A 210 nt-3.7□□□□□ -3
DNF2Q12675 YBR196C-AYBR196C-A 150 nt-3.7□□□□□ -3
DNF2Q12675 YFL019CYFL019C 354 nt-3.76□□□□□ -3.01
DNF2Q12675 STE18YJR086W 333 nt-3.8□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 snR60snR60 104 nt-3.82□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 YLR412C-AYLR412C-A 207 nt-3.82□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 YBR178WYBR178W 375 nt-3.82□□□□□ -3.02
DNF2Q12675 snR6snR6 112 nt-3.84□□□□□ -3.02
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 7.9 ms