Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
NrepQ07475 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
NrepQ07475 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms