Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cxcr5Q04683 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.6 ms