Protein–RNA interactions for Protein: P83917

Cbx1, Chromobox protein homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx1P83917 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cbx1P83917 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cbx1P83917 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms