Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppfia3P60469 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia3P60469 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms