Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Gsc2P56916 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Gsc2P56916 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms