Protein–RNA interactions for Protein: P49962

Srp9, Signal recognition particle 9 kDa protein, mousemouse

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Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp9P49962 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp9P49962 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp9P49962 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Srp9P49962 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp9P49962 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Srp9P49962 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Srp9P49962 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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