Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
PtpreP49446 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
PtpreP49446 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms