Protein–RNA interactions for Protein: P41105

Rpl28, 60S ribosomal protein L28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl28P41105 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Rpl28P41105 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Rpl28P41105 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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