Protein–RNA interactions for Protein: P38398

BRCA1, Breast cancer type 1 susceptibility protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRCA1P38398 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BRCA1P38398 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BRCA1P38398 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms