Protein–RNA interactions for Protein: P38117

ETFB, Electron transfer flavoprotein subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFBP38117 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
ETFBP38117 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ETFBP38117 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFBP38117 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ETFBP38117 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ETFBP38117 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ETFBP38117 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms