Protein–RNA interactions for Protein: P31316

Gsx2, GS homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsx2P31316 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gsx2P31316 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms