Protein–RNA interactions for Protein: P28352

Apex1, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apex1P28352 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Apex1P28352 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms