Protein–RNA interactions for Protein: P27048

Snrpb, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpbP27048 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnrpbP27048 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms