Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rps6ka3P18654 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rps6ka3P18654 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms