Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cd48P18181 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms