Protein–RNA interactions for Protein: P11438

Lamp1, Lysosome-associated membrane glycoprotein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp1P11438 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Lamp1P11438 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Lamp1P11438 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms