Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nid1P10493 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nid1P10493 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms