Protein–RNA interactions for Protein: P03987

Ig gamma-3 chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P03987 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03987 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03987 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03987 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03987 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P03987 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P03987 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P03987 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P03987 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
P03987 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P03987 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P03987 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms