Protein–RNA interactions for Protein: O35343

Kpna4, Importin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna4O35343 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Kpna4O35343 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Kpna4O35343 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms