Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

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Length 497 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
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Kcns1O35173 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcns1O35173 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
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Kcns1O35173 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcns1O35173 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms