Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Kcnk3O35111 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Kcnk3O35111 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Kcnk3O35111 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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