Protein–RNA interactions for Protein: L7N2E3

Gm8050, Predicted gene 8050, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8050L7N2E3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm8050L7N2E3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms