Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
BC117090L7N257 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
BC117090L7N257 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms