Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Vmn1r34G3XA52 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms