Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Vmn1r58G3X9U3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Vmn1r58G3X9U3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms