Protein–RNA interactions for Protein: F6YH22

Gm5218, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5218F6YH22 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Gm5218F6YH22 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Gm5218F6YH22 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms