Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3T6

Prdm14, PR domain zinc finger protein 14, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm14E9Q3T6 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Prdm14E9Q3T6 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prdm14E9Q3T6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms