Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0B4

Cdr1, Cerebellar degeneration-related antigen 1, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdr1E9Q0B4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cdr1E9Q0B4 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Cdr1E9Q0B4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms