Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PtpruB1AUH1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PtpruB1AUH1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PtpruB1AUH1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
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