Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Pkd2l1A2A259 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms