Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 IST1-208ENST00000535424 4082 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 NR1I2-203ENST00000466380 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 EIF4B-201ENST00000262056 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AFAP1-202ENST00000360265 7479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 MPPED2-201ENST00000358117 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 PLEKHS1-207ENST00000619563 3247 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 TSC22D2-201ENST00000361875 11154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 U3.25-201ENST00000391209 220 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL139806.1-201ENST00000403057 1002 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL121835.1-201ENST00000404250 354 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 SLC19A3-202ENST00000409287 644 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 ADAMTS3-201ENST00000286657 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 AC079921.2-201ENST00000507579 455 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RPL10P18-201ENST00000519384 309 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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PTPRMP28827 LINC00556-201ENST00000569603 412 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 LINC01919-201ENST00000578610 568 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 RBM4-213ENST00000578778 582 ntTSL 4 BASIC10.17□□□□□ -0.78
PTPRMP28827 AL589863.1-201ENST00000595383 631 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
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