Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP005328.2-201ENST00000606879 657 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC079602.4-201ENST00000637836 532 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MBNL2-203ENST00000376673 4632 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INPP4B-212ENST00000507861 1506 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLT1-206ENST00000615611 1476 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01847-203ENST00000641163 1490 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCX-211ENST00000637570 6162 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNMT-201ENST00000262173 6051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ADAM7-203ENST00000441335 1417 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC02477-201ENST00000512652 1417 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC107058.1-201ENST00000513297 1384 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VNN3-212ENST00000519686 1377 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01043-201ENST00000565936 6897 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC027575.3-201ENST00000583058 2747 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC011374.1-201ENST00000564471 1567 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR2T29-202ENST00000641069 2637 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AFM-201ENST00000226355 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GABRG2-228ENST00000640985 3086 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FCAR-201ENST00000345937 608 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106795.2-203ENST00000366189 511 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MLXIP-203ENST00000377037 805 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR637-201ENST00000385000 99 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007091.1-201ENST00000412563 566 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009229.2-201ENST00000417213 351 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BPI-202ENST00000417318 1082 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKR1B1P8-201ENST00000418396 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPSAP53-201ENST00000433498 862 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BX322234.2-202ENST00000435612 479 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01422-202ENST00000438113 517 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355355.1-201ENST00000442900 793 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OR5S1P-201ENST00000453063 951 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005515.1-201ENST00000456368 289 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HNRNPCP10-201ENST00000457130 884 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAP3P2-201ENST00000458547 510 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL55P-201ENST00000464534 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL554P-201ENST00000468197 292 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL333P-201ENST00000476398 297 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL403P-201ENST00000481783 305 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL291P-201ENST00000487916 289 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097263.1-201ENST00000496795 606 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC123768.2-201ENST00000500941 732 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC096741.2-201ENST00000510225 637 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRD5A3-AS1-202ENST00000510637 926 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDPN-209ENST00000510906 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANKRD55-205ENST00000513241 626 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TECRP1-201ENST00000513307 445 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC226119.2-201ENST00000513501 530 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC044839.4-201ENST00000534128 469 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004828.1-201ENST00000555303 654 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007614.3-201ENST00000564875 654 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC074051.4-201ENST00000564888 892 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007495.1-202ENST00000565155 559 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL023284.3-202ENST00000571188 543 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC060766.6-201ENST00000589099 394 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01483-205ENST00000591334 620 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF83-209ENST00000596930 560 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023513.1-201ENST00000604396 691 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL137246.2-201ENST00000613439 662 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026951.2-201ENST00000613847 241 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009120.7-201ENST00000623452 780 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA43.5-201ENST00000631270 138 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL450990.1-201ENST00000632868 582 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC106774.10-201ENST00000638486 599 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZC3H8-208ENST00000615791 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FOPNL-201ENST00000255759 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CR1-201ENST00000367049 7470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGBL1-205ENST00000635782 3201 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z96074.1-203ENST00000637685 1746 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLHL13-202ENST00000371876 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002512.4-202ENST00000641599 4530 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAMD13-201ENST00000370668 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG6-209ENST00000538630 2376 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN5-203ENST00000554120 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SRSF3-202ENST00000373715 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L14-203ENST00000308721 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ENTPD1-AS1-212ENST00000458228 3274 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01722-201ENST00000456265 3033 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP5A1P10-201ENST00000622403 1603 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCDC125-202ENST00000396496 4198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPEB2-AS1-202ENST00000501916 1806 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO25-204ENST00000382824 10386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLRE1C-205ENST00000378249 2246 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARIH1-201ENST00000379887 21681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL4P3-201ENST00000428881 1311 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.1 ms